由于暹罗（泰国的古称）兴起，不但摆脱了柬埔寨的统治，且于1430及1431年围攻吴哥，围城7个月后得以攻陷，大肆烧杀劫掠后弃城而去。受此沉重打击，吴哥文明自此走向衰落。1432年，柬埔寨不得不放弃北部诸省，迁都巴山（Basan），1434年再度迁至金边(Phnom Penh)。吴哥城被完全弃置，直至湮没在莽莽的热带丛林中为世人所遗忘，真正成为一个失落的东方之梦，时间竟长达四百年。
迷失的吴哥文明的重新发现：由于连年战火，有关吴哥时代的重要文献、文物悉数被毁。随着时间的推移、年代的久远，柬埔寨人自身对于吴哥帝国的记忆也变得越来越模糊。此时，中国古籍中有关吴哥帝国的记载，特别是中国元朝使臣随员周达观（公元1297年至1298年随元朝使臣出使柬埔寨）所著的《真腊风土记》成为世人了解吴哥王朝最为重要的文献。
《真腊风土记》详细记载了真腊首都吴哥城，记叙了吴哥城宏伟的建筑、精美的雕刻，记录了吴哥帝国繁荣昌盛的概貌。更为重要的是，周达观详细叙述了他到达吴哥城的航线：经南海、入湄公河口，溯流而上，渡洞里萨湖，在湖西北登岸。
十九世纪中期，法国人亨利.穆奥（Henri Mouhot)按图索骥般，终于揭开了在热带丛林中静静沉睡了几个世纪的吴哥古迹的神秘面纱，伟大的吴哥文明终于重现于世。
